La iglesia y exconvento, cuya advocación es dedicada al arcángel San Miguel en Acatlán -pertenece a la orden de San
Agustín y se comienza a construir en 1544-, por lo que el pueblo toma su nombre hasta finales del Siglo XVIII. Se ignora quiénes fueron sus constructores pues hasta la fecha no se ha encontrado
ningún documento que hable de ello. La documentación más antigua del archivo parroquial es un libro de casamientos que se inicia en 1569.
En esta misma fecha, el agustino Fray Juan de Santa Catarina informaba que existía un convento donde residían tres religiosos: un prior, un teólogo y un predicador confesor de españoles, además
de otro religioso que predicaba en lengua mexicana y otomí.
El convento tenía las siguientes cofradías: Nuestra Señora de la Soledad, Nuestra Señora de la Purificación, la Santísima Virgen María, Nuestro Padre Jesús de Nazareno, Nuestro Señor del Santo
Entierro y Nuestro Señor de San José. Mismas que eran administradas por mayordomos y cofrades de las rancherías de Cacaloapan, Mixquiapan, Totoapa, Tepenacasco, Santo Domingo y San Dionisio,
donde también existían terrenos de labor, propiedad de los agustinos.
El período agustino de Acatlán, se inició a mediados del siglo XVI y terminó el 11 de abril de 1745, cuando el convento fue secularizado teniendo como primer cura al bachiller Don Miguel
Echeverría.
El antiguo convento de Acatlán representa una de las valiosas joyas patrimoniales del siglo XVI, de éste municipio, cuenta con todos lo elementos del estilo arquitectónico monacal.
